miniconda的配置及使用

bitahu
  2023-05-25 22:27:20 2023-05-25 22:27 Created   2023-05-26 17:28:26 2023-05-26 17:28 Updated    428 Words
1. miniconda的下载及安装
  1. 从官网下载适合版本的miniconda：Miniconda — conda documentation
  2. 安装miniconda
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# sh安装
sh Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

# 刷新环境变量
source ~/.bashrc
2. 配置.condarc文件

在 /home/user/ 下新建.condarc文件，参照下列网站配置镜像channels。

清华conda：anaconda | 镜像站使用帮助 | 清华大学开源软件镜像站 | Tsinghua Open Source Mirror

北京外国语conda：anaconda | 镜像站使用帮助 | 北京外国语大学开源软件镜像站 | BFSU Open Source Mirror

北京大学conda：帮助-北京大学开源镜像站 (pku.edu.cn)

南京大学conda：Anaconda 软件仓库镜像使用帮助 - MirrorZ Help (nju.edu.cn)

南方科技大学conda：Anaconda Mirror | SUSTech Open Source Mirrors

上海交大conda：上海交通大学 Linux 用户组 软件源镜像服务 (sjtu.edu.cn)

 

配置完成后运行 conda clean -i 清除索引缓存，保证用的是镜像站提供的索引。

3. 查看可下载包及conda可提供版本

bioconda :: Anaconda.org

4. conda常用功能
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# 输出conda的配置
conda config --show

# 更新conda版本
conda update -n base conda

# 列出conda已安装的包
conda list

# 使用conda从所有Channels中搜索包
conda search xxx

# 安装n.n.n版本的包
conda install xxx=n.n.n

# 更新xxx包
conda update xxx

# 卸载xxx包
conda uninstall xxx   

# 列出指定环境的所有包
conda list -n ENVNAME

# 升级环境下的所有包, 同样可以指定环境
conda update --all -n ENVNAME  

# 删除索引缓存、锁定文件、未使用过的包和tar包
conda clean -a


# 查看conda虚拟环境
conda info -e 

#创建conda虚拟环境
conda create -n ENVNAME python=n.n
 
 # 删除虚拟环境
conda remove -n ENVNAME --all

# 激活虚拟环境
conda activate ENVNAME

# 退出虚拟环境
conda deactivate
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